11. Dezember 2023

Shopify Warenwirtschaftssysteme im Vergleich: ERP & WaWi für deinen Shop

Werner Strauch
Werner Strauch Geschäftsführer & E-Commerce Stratege
Shopify Warenwirtschaftssysteme im Vergleich 2026: JTL, Billbee, xentral und Co.

Shopify reicht bis zu einem bestimmten Punkt. Wer nur einen Kanal betreibt und unter 100 Bestellungen pro Monat abwickelt, kommt mit der eingebauten Bestandsverwaltung gut durch. Danach nicht mehr: GoBD-konforme Rechnungsstellung, Multi-Channel-Anbindung, Barcode-Scanning, DATEV-Export, das deckt Shopify nativ nicht ab. Dafür gibt es externe Shopify Warenwirtschaftssysteme.

Dieser Vergleich zeigt die sieben am häufigsten genutzten WaWi- und ERP-Systeme mit Shopify-Anbindung: JTL-Wawi, Billbee, xentral, plentyONE, weclapp, Pickware und Lexoffice. Für technische Einrichtungsanleitungen zu den einzelnen Systemen gibt es separate Guides.

Wann reicht Shopify allein, und wann brauchst du eine Shopify Warenwirtschaft?

Shopify bringt eine eingebaute Bestandsverwaltung mit. Sie deckt Produktvarianten, Lagerbestände, Bestandswarnungen und einfache Einkaufsbestellungen ab. Für viele Shops im Aufbau ist das ausreichend.

Ab 100 bis 300 Bestellungen pro Monat ändert sich das, spätestens wenn du einen zweiten Verkaufskanal hinzufügst. Was Shopify nativ nicht kann:

  • Automatisierte Kommissionierlisten und Lager-Workflows
  • Multi-Lager-Verwaltung
  • Auftragsabwicklung über mehrere Kanäle (Amazon, eBay, OTTO, Kaufland)
  • GoBD-konforme Rechnungsstellung mit DATEV-Export
  • Seriennummern- und Chargenverfolgung
  • B2B-Preislisten und Netto-Rechnungsstellung

Welche Kosten insgesamt beim Shopify-Betrieb anfallen, erklärt unser Artikel Was kostet Shopify?.

WaWi vs. ERP: Der Unterschied

Beide Begriffe werden im E-Commerce oft synonym verwendet. Für die meisten Kaufentscheidungen ist der Unterschied weniger relevant als die konkreten Funktionen.

Eine WaWi (Warenwirtschaftssystem) deckt den Warenfluss ab: Lager, Bestellungen, Kommissionierung, Versand, Rechnungsstellung. Für den Großteil der Shopify-Händler reicht das.

Ein ERP geht weiter. Buchhaltung, Personalwesen, Controlling und CRM kommen in einem System zusammen, statt über separate Tools. Sinnvoll, wenn du genau das willst.

JTL und Billbee sind reine WaWi-Systeme. xentral, weclapp und plentyONE sind ERPs mit integrierter WaWi. Pickware ist ein Shopify-natives Warenwirtschaftssystem. Lexoffice ist primär Buchhaltungssoftware mit WaWi-ähnlichen Funktionen für kleine Shops.

WaWi-Finder: Welches System passt zu deinem Shopify-Shop?

WaWi-Finder: Welches Warenwirtschaftssystem passt zu deinem Shopify-Shop?

Drei Fragen, eine Empfehlung. Beantworte die Fragen zu deinem Shop und sieh, welche Shopify Warenwirtschaft am besten passt.

Wie viele Bestellungen verarbeitest du pro Monat?

Über welche Kanäle verkaufst du oder planst du zu verkaufen?

Was ist dein monatliches Budget für die WaWi-Software?

Deine Empfehlung

Shopify Lagerverwaltung reicht vorerst

Bei unter 50 Bestellungen pro Monat und einem einzigen Shopify-Shop brauchst du keine externe Warenwirtschaft. Shopify's eingebaute Bestandsverwaltung deckt Lagerbestände, Produktvarianten und einfache Bestandswarnungen ab. Eine externe WaWi lohnt sich, wenn du auf 100+ Bestellungen wächst oder einen zweiten Kanal hinzufügst.

JTL-Start (kostenlos)

JTL-Start ist die kostenlose Einstiegsversion von JTL-Wawi und deckt die wichtigsten WaWi-Funktionen ab: Auftragsmanagement, Lager, Kommissionierung, Rechnungserstellung. Für deinen Bestellumfang und Budget ist das der logische Einstieg. Wenn du wächst, kannst du auf JTL-Advanced oder JTL-Pro upgraden.

Billbee

Billbee ist die günstigste und am einfachsten einzurichtende WaWi für Shopify-Händler in deiner Größenordnung. Die Abrechnung erfolgt nach Bestellvolumen, nicht nach Nutzeranzahl, was sie besonders für den Einstieg in den Multi-Channel-Verkauf attraktiv macht. GoBD-konforme Rechnungserstellung ist inklusive.

JTL-Wawi (Advanced oder Pro)

Bei deinem Bestellvolumen und Multi-Channel-Bedarf ist JTL-Wawi die naheliegende Wahl. JTL ist der Marktführer unter deutschen Online-Händlern und deckt Shopify, Amazon, eBay, Kaufland und mehr über einen Connector ab. Die Windows-Basis und das Setup erfordern etwas Zeit, aber die Community und der deutsche Support sind solide.

Pickware

Da du ausschließlich über Shopify verkaufst, ist Pickware die nahtloseste Option. Es läuft direkt im Shopify Admin als App, kein separates Programm. Lagerverwaltung, Kommissionierung und Versand sind tief in Shopify integriert. Besonders sinnvoll, wenn du ein physisches Lager betreibst.

xentral

Bei deinem Wachstum lohnt sich xentral als Lean ERP. Es verbindet Warenwirtschaft, Einkauf, Buchhaltung und Shopify-Integration in einem Cloud-System. Besonders beliebt bei D2C-Brands, die schnell skalieren und keine separate Buchhaltungssoftware daneben betreiben wollen.

plentyONE (ehemals plentymarkets)

Für dein Volumen und deinen Omnichannel-Bedarf ist plentyONE die leistungsstärkste Option. Das System ist auf hohe Bestellvolumen und viele gleichzeitige Kanäle ausgelegt, inklusive eigener Shop-Plattform. Das Setup ist komplex, der Funktionsumfang aber entsprechend groß.

Die 7 besten Shopify Warenwirtschaftssysteme im Überblick

JTL-Wawi: Marktführer für deutsche Online-Händler

JTL-Wawi ist das meistgenutzte Warenwirtschaftssystem unter deutschen Online-Händlern. Die Basisversion JTL-Start ist kostenlos und deckt Auftragsmanagement, Lager, Kommissionierung, Versand und GoBD-konforme Rechnungsstellung ohne Lizenzkosten ab.

Die Anbindung an Shopify läuft über den JTL-Connector, der volumenbasiert abgerechnet wird. Einrichtung und Kosten erklärt unser Guide JTL Shopify Connector.

EditionMonatliche LizenzBesonderheit
JTL-StartkostenlosUnbegrenzte Artikel, bis 3 Benutzer
JTL-Advanced99 EURMehr Benutzer, erweiterte WMS-Funktionen
JTL-Proab 199 EURIndividuelle Konfiguration, große Teams

Die größte deutsche WaWi-Community, umfassende Multi-Channel-Abdeckung über Shopify, Amazon, eBay, OTTO und Kaufland, ein eigenes Versandtool (JTL-Shipping) und Barcode-Scanning sprechen für JTL. Der Windows-Client ohne native Mac-Version und ein Setup, das Zeit und technisches Verständnis braucht, sind Einschränkungen, die viele Einsteiger unterschätzen.

Passt am besten für: Etablierte Händler mit 200 und mehr Bestellungen pro Monat und Multi-Channel-Bedarf.

Billbee: Günstiger Einstieg in die Shopify Warenwirtschaft

Billbee rechnet nach Bestellvolumen ab, nicht nach Nutzerzahl. Für Shops, die erst in den Multi-Channel-Verkauf einsteigen, ist das der günstigste Weg zu einer funktionsfähigen Warenwirtschaft für Shopify.

Unterstützt werden Shopify, Amazon, eBay, Etsy, Avocadostore, Kaufland, idealo und weitere Kanäle direkt. GoBD-konforme Rechnungsstellung und DATEV-Export sind inklusive.

PaketPreis abBestellungen inkl.
Starter9 EUR/Mobis 10 Bestellungen
Wachstum19 EUR/Mobis 50 Bestellungen
Progestaffeltnach Volumen

Intuitiv einzurichten, keine Einrichtungsgebühren, gute Multi-Channel-Abdeckung. Bei über 1.000 Bestellungen pro Monat überholt JTL-Wawi Billbee preislich. Barcode-Scanning im physischen Lager ist nicht vorhanden.

Passt am besten für: Shopify-Händler im Aufbau, die günstig mit Multi-Channel starten wollen.

xentral: Shopify ERP für wachsende D2C-Brands

xentral ist kein reines WaWi-System, sondern ein Lean ERP. Neben Lager und Auftragsmanagement sind Einkauf, Buchhaltung und Rechnungswesen direkt integriert. Wer keine separate Buchhaltungssoftware daneben betreiben will, findet hier alles in einem.

xentral ist cloudbasiert, kein lokaler Client. Die Shopify-Integration läuft über einen nativen Connector. Das System ist besonders verbreitet bei D2C-Brands, die schnell skalieren.

PaketPreis abNutzer inkl.
Lean149 EUR/Mo2 Nutzer
Growth299 EUR/Mo5 Nutzer
Enterpriseindividuellunbegrenzt

Modernes Interface, starke API, native Buchhaltungsintegration. Der Einstiegspreis liegt deutlich über JTL oder Billbee, manche Module haben eine Lernkurve, und in der WMS-Funktionstiefe bleibt JTL das stärkere System.

Passt am besten für: D2C-Brands und wachstumsorientierte Händler, die Warenwirtschaft und Buchhaltung in einem System zusammenführen wollen.

Welche Buchhaltungslösungen für Shopify sonst noch infrage kommen, zeigt unser Artikel Shopify Buchhaltung Software im Vergleich.

plentyONE: Für Multi-Channel-Händler mit hohem Volumen

plentyONE, vormals plentymarkets, ist ein Cloud-ERP für hohe Bestellvolumen und viele gleichzeitige Verkaufskanäle. Das System bringt eine eigene Shop-Plattform (plentyShop) mit, die Shopify-Anbindung läuft über ein Marketplace-Modul.

Shopify, Amazon, eBay, OTTO, Kaufland, Zalando und weitere Kanäle werden abgedeckt. Der Funktionsumfang ist groß, das Setup entsprechend aufwändig.

PaketPreis ab
Essential199 EUR/Mo
Classic349 EUR/Mo
Flexindividuell

Leistungsfähige Multi-Channel-Abdeckung, EU-Daten-Hosting, natives WMS mit Barcode-Scanning, umfangreiches Reporting. Für reine Shopify-Händler ist plentyONE häufig überdimensioniert, das Setup ist komplex, und die eigene Shoplösung ist primär auf plentyShop ausgerichtet.

Passt am besten für: Händler mit 500 und mehr Bestellungen pro Monat über mindestens drei Kanäle.

weclapp: Cloud ERP mit CRM für den deutschen Mittelstand

weclapp kombiniert WaWi, CRM, Buchhaltung und Projektmanagement in einer cloudbasierten Plattform und wurde mehrfach zur ERP-Software des Jahres gewählt. Das Hosting erfolgt in Deutschland, was für DSGVO-sensible Setups relevant ist.

Die Shopify Schnittstelle ist über einen nativen Connector verfügbar.

PaketPreis ab
Standard39 EUR/Mo pro Nutzer
Professional79 EUR/Mo pro Nutzer
Enterpriseindividuell

Deutsches Hosting, native DATEV-Integration, starkes CRM, guter Support. Das Preismodell nach Nutzerzahl wird bei wachsenden Teams teuer, und der Shopify-Connector läuft über eine Middleware-Schicht.

Passt am besten für: SMBs, die Warenwirtschaft, CRM und Buchhaltung in einem deutschen Cloud-System zusammenführen wollen.

Pickware: Shopify-natives Warenwirtschaftssystem

Pickware läuft direkt als Shopify-App im Shopify-Admin. Kein separates Programm, kein Daten-Export. Lagerbestände, Kommissionierung, Versand und Rechnungsstellung sind nativ in Shopify integriert, das Hosting erfolgt in Deutschland.

PaketPreis ab
Starter119 EUR/Mo
Professional179 EUR/Mo
Enterpriseindividuell

Tiefste Shopify-Integration im Vergleich, kein Daten-Sync nötig, Live-Bestandsaktualisierung, Barcode-Scanning, kein separates System zu lernen. Außerhalb von Shopify funktioniert Pickware nicht, Multi-Channel zu anderen Marktplätzen ist nicht vorgesehen, und im Einstieg ist Pickware teurer als Billbee.

Passt am besten für: Shopify-fokussierte Händler mit physischem Lager, die keine weiteren Marktplätze anbinden müssen.

Lexoffice: Oft ausreichend für kleinere Shops

Lexoffice ist kein Warenwirtschaftssystem. Es ist Buchhaltungssoftware mit einer direkten Shopify-Integration. Für Shops mit unter 100 Bestellungen pro Monat ohne komplexe Lagerprozesse ersetzt die Kombination aus Shopify und Lexoffice häufig eine separate WaWi.

Die Integration synchronisiert Bestellungen, erstellt automatisch GoBD-konforme Rechnungen und exportiert in Richtung DATEV. Was genau funktioniert und wie die Einrichtung läuft, erklärt unser Guide Shopify mit Lexoffice verbinden.

Passt am besten für: Micro-Shops mit weniger als 100 Bestellungen pro Monat ohne physisches Lager.

Welche Shopify Warenwirtschaft passt zu deinem Shop und deinen Prozessen?

Wir analysieren deinen aktuellen Setup und empfehlen dir das WaWi-System, das zu deinem Volumen, deinen Kanälen und deinem Budget passt.

Vergleichstabelle: Shopify Warenwirtschaftssysteme auf einen Blick

SystemTypPreis abShopify-IntegrationMulti-ChannelBesonderheit
JTL-WawiWaWikostenlosJTL-ConnectorJa (Amazon, eBay, OTTO)Marktführer DE
BillbeeWaWi9 EUR/MoDirektJa (viele Kanäle)Günstigster Einstieg
xentralLean ERP149 EUR/MoDirektJaWaWi + Buchhaltung
plentyONEERP199 EUR/MoMarketplace-ModulJa (sehr breit)Eigene Shop-Plattform
weclappCloud ERP39 EUR/Mo/NutzerDirektEingeschränktCRM + WaWi + Buchhaltung
PickwareWaWi119 EUR/MoShopify-AppNein (nur Shopify)Tiefste Shopify-Integration
LexofficeBuchhaltung7 EUR/MoDirektNeinKein WaWi-Ersatz

So wählst du das richtige Warenwirtschaftssystem für Shopify

Bestellvolumen, Vertriebskanäle und Prozesse, diese drei Punkte entscheiden die Auswahl.

Unter 100 Bestellungen pro Monat ist der Aufwand in Shopify oft noch händelbar. Ab 300 Bestellungen wird eine externe Shopify Warenwirtschaft zum echten Zeitgewinn, besonders in der Auftragsabwicklung und Rechnungsstellung.

Wer ausschließlich über Shopify verkauft, kommt mit Pickware oder Billbee gut durch. Wer Amazon und eBay parallel betreibt, braucht Multi-Channel-Fähigkeit, wie sie JTL, Billbee oder plentyONE bieten.

Vier Fragen, die zur richtigen Entscheidung führen: Wie viele Bestellungen habe ich in zwölf Monaten? Über welche Kanäle verkaufe ich? Wo entstehen die meisten Fehler in meinen Prozessen? Welche Tools muss das System ablösen oder integrieren?

Wichtige Integrationen: Buchhaltung, Versand und Marktplätze

Die Qualität einer Shopify Warenwirtschaft hängt stark von ihren Integrationen ab.

Für DATEV-Anbindung und GoBD-konforme Prozesse sind JTL, xentral und weclapp am stärksten. Billbee bietet DATEV-kompatible Exporte. Wer mit Lexoffice oder Lexware arbeitet, findet direkte Anbindungen bei fast allen Systemen. Eine Übersicht der Buchhaltungsoptionen für Shopify-Händler liefert unser Artikel Shopify Buchhaltung Software im Vergleich.

Beim Versand ist JTL-Shipping das leistungsfähigste Tool im deutschen WaWi-Umfeld, mit Unterstützung für DHL, DPD, Hermes, UPS und GLS. Billbee und Pickware decken die gängigen Versanddienstleister ebenfalls ab. Welche Versandapps für Shopify sich bewährt haben, erklärt unser Überblick Shopify Versanddienstleister-Apps.

Für B2B-Szenarien mit Preislisten, Netto-Rechnungsstellung und Kreditlimits sind xentral und weclapp die stärksten Optionen im Warenwirtschaftssystem-Vergleich. Wie B2B-Strukturen in Shopify grundsätzlich aufgebaut werden, zeigt unser Artikel Shopify B2B umsetzen.

Wie du Warenkorbabbrüche im Checkout reduzierst, erklärt unser Guide zu Warenkorbabbrüchen bei Shopify.

Datenschutz und Hosting: Was für deutsche Händler zählt

Wo deine Bestell- und Kundendaten landen, ist ein Punkt, den viele Shopify WaWi-Vergleiche übergehen.

JTL-Wawi ist eine Desktop-Anwendung, Daten liegen lokal oder auf deinem eigenen Server. xentral hostet in Deutschland und Irland. weclapp hostet ausschließlich in Deutschland. plentyONE hostet in der EU. Pickware und Billbee hosten in Deutschland.

Alle genannten Systeme sind für DSGVO-konforme Setups geeignet, sofern der Auftragsverarbeitungsvertrag (AVV) abgeschlossen wird, was alle Anbieter standardmäßig anbieten.

WaWi-Setup aufsetzen oder bestehende Shopify Schnittstelle optimieren?

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FAQ: Shopify Warenwirtschaftssysteme

Die Faustregel: Ab 100 bis 300 Bestellungen pro Monat oder sobald du einen zweiten Verkaufskanal (z.B. Amazon, eBay) hinzufügst. Auch wenn du GoBD-konforme Rechnungsstellung, Barcode-Scanning im Lager oder Multi-Lager-Verwaltung benötigst, lohnt sich ein externes Shopify Warenwirtschaftssystem unabhängig vom Volumen.

Eine WaWi (Warenwirtschaftssystem) deckt den Warenfluss ab: Lager, Aufträge, Kommissionierung, Versand und Rechnungsstellung. Ein ERP-System erweitert das um Buchhaltung, CRM, Personalwesen und Controlling. Für die meisten Shopify-Händler ist eine WaWi ausreichend. ERP-Systeme wie xentral oder weclapp sind sinnvoll, wenn du diese Bereiche in einem System zusammenführen willst.

JTL-Start ist kostenlos und deckt die wichtigsten WaWi-Funktionen ab: Auftragsmanagement, Lager, Kommissionierung, Versand und Rechnungsstellung. Kostenpflichtig sind JTL-Advanced (99 EUR/Mo) und JTL-Pro (ab 199 EUR/Mo) für erweiterte WMS-Funktionen und mehr Benutzer. Zusätzlich fällt eine volumenbasierte Gebühr für den JTL-Connector an, der die Shopify Schnittstelle herstellt.

JTL-Start ist kostenlos (nur der Shopify-Connector kostet extra). Billbee startet bei 9 EUR pro Monat für bis zu 10 Bestellungen. Für kleine Shops ist Billbee oft günstiger als der JTL-Connector. Lexoffice (ab 7 EUR/Mo) ist kein vollständiges WaWi-System, aber ausreichend für Micro-Shops ohne komplexe Lagerprozesse.

JTL-Wawi ist die stärkste Option für die Kombination Amazon und Shopify. JTL-Connector verbindet Shopify, JTL-Amazon verbindet den Marktplatz. Billbee unterstützt beide Kanäle ebenfalls direkt und ist günstiger im Einstieg. plentyONE ist bei sehr hohem Multi-Channel-Volumen mit vielen weiteren Kanälen die leistungsfähigste Option.

Ja, aber ein WaWi-Wechsel ist aufwändig. Stammdaten (Artikel, Kunden, Lieferanten), offene Bestellungen und Lagerbestände müssen migriert werden. Plane mindestens vier bis acht Wochen Parallelbetrieb ein, um Datenverluste zu vermeiden. Am aufwändigsten ist der Wechsel bei Systemen mit proprietären Datenformaten.

Pickware und weclapp hosten ausschließlich in Deutschland. Billbee und plentyONE hosten in der EU. xentral hostet in Deutschland und Irland. JTL-Wawi ist eine Desktop-Anwendung, deine Daten liegen lokal oder auf deinem eigenen Server. Alle Anbieter bieten DSGVO-konforme Auftragsverarbeitungsverträge (AVV) an.

Wenn du weniger als 100 Bestellungen pro Monat hast, kein physisches Lager betreibst und nur über Shopify verkaufst, reicht die Kombination Shopify und Lexoffice häufig aus. Lexoffice erstellt GoBD-konforme Rechnungen automatisch aus Shopify-Bestellungen und exportiert für DATEV. Sobald du ein Lager, Multi-Channel oder Barcode-Scanning brauchst, ist ein echtes Warenwirtschaftssystem für Shopify nötig.

Das hängt stark vom System ab. Billbee ist in ein bis zwei Stunden eingerichtet. JTL-Wawi erfordert für die Grundkonfiguration inkl. Connector-Setup typischerweise ein bis drei Tage. plentyONE und xentral haben einen längeren Onboarding-Prozess von zwei bis vier Wochen für ein vollständiges Setup. Plane zusätzlich Zeit für Stammdaten-Import und Tests ein.

Der JTL-Shopify-Connector wird volumenbasiert abgerechnet. Die Gebühr richtet sich nach der Anzahl der monatlichen Bestellungen. Alle Details zu Preisen und Einrichtung erklärt unser Artikel zum JTL Shopify Connector.

Fazit: Welches Shopify Warenwirtschaftssystem für wen

JTL-Wawi ist für die meisten deutschen Online-Händler mit Multi-Channel-Bedarf die erste Wahl, schon weil JTL-Start kostenlos ist. Billbee ist der günstigere Einstieg für Single- oder Early-Multi-Channel-Setups. Pickware ist für Shopify-only-Händler mit Lager die sauberste Lösung. xentral und weclapp eignen sich, wenn Warenwirtschaft und Buchhaltung in einem System laufen sollen. plentyONE ist für hohes Volumen mit vielen Kanälen gebaut.

Für Shops unter 100 Bestellungen pro Monat ohne physisches Lager reicht oft die Kombination aus Shopify und Lexoffice.

Der WaWi-Finder oben gibt eine erste Orientierung. Wenn du konkrete Fragen zu deinem Setup hast, schau dir die jeweiligen Systemseiten an oder frag uns direkt.

Du willst wissen, welches Shopify Warenwirtschaftssystem zu deinem konkreten Setup passt?

Als Shopify-Agentur haben wir Erfahrung mit allen genannten Systemen. Wir helfen dir, die richtige Wahl zu treffen und richten die Anbindung ein.


Quellen

  1. JTL Software: JTL-Wawi Produktübersicht - Editionen, Preise, Shopify-Anbindung
  2. Billbee: Billbee Shopify-Schnittstelle - Preismodell und Funktionen
  3. xentral: xentral ERP für Shopify - Pakete und Integration
  4. plentyONE: plentyONE Marketplace - Shopify-Connector
  5. weclapp: weclapp Shopify Integration - Connector-Details
  6. Pickware: Pickware Shopify WaWi - Produktübersicht und Preise
  7. Lexoffice: Lexoffice Shopify-Integration - Verbindungsdetails
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